Der Macintosh IIsi ist eine kostenreduzierte Version des IIci. Das Gehäuse ist deutlich flacher, wodurch keine Steckkarten mehr senkrecht hineinpassen. Über einen Adapter kann man aber zumindest eine liegend unterbringen.

Da dies alleine den beinahe halbierten Preis kaum gerechtfertigt hätte, wurde zudem der Prozessor von 25 auf 20 MHz gedrosselt - obwohl die eingebauten Komponenten den höheren Takt vertragen hätten. Viele Anwender machten die Drosselung daher rückgängig.